Lite-C und C-Skript zu kombinieren ist, oder war zumindest mal möglich, ist aber nicht zu empfehlen.
Du kannst AFAIK in Lite-C WDL Dateien includen, das wurde mal so gemacht, damit das konvertieren von C-Skript zu Lite-C einfacher ist. In der gepublishten Version kannst du das aber nicht mehr machen.
Außerdem kannst du eine WDL mit dem gleichen Namen wir dein Lite-C Skript machen, das wird dann mit kompiliert, wenn du dein Lite-C Skript startest. Das ist für Paths, Startfenster, usw. aber du kannst da theoretisch auch anderen Code reinmachen. Ich würds aber nicht empfehlen.
Erstere Variante könnte dir zumindest helfen, deinen Code Stück für Stück zu konvertieren.