Hm, da bin ich überfragt. Im Vollbildmodus solltest Du das Programm ja ohnehin nicht sehen. Ansonsten könnte man wget mit der Option -q starten. Dann gibt es keine Ausgabe. Ansonsten vielleicht ein Umweg über die Windows Funktion "start"? Mit der /min Option könntest Du die Anwendung dann minimiert starten.