Du kannst die entities natürlich mit ent_remove oder ptr_remove löschen. Sinnvoller ist es aber die entities dann in der Mitte des Levels, oder wo sonst sie auch immer gebraucht werden einfach wieder zu verwenden. Dafür musst Du ja im Wesentlichen nur die x, y und z Koordinaten wieder zurücksetzen.
Always learn from history, to be sure you make the same mistakes again...