Ich habe relativ oft, daß nach dem abspeichern das mesh auf einer ebne auf dem "Boden" liegt. Ich nenne das matsch. Normalerweise passiert das nach einem Merge und anpassen des neuen teils.
Von daher habe ich es mir zur angewohnkeit gemacht, grundsätzlich nach jedem abspeichern in das 3d fenster zu gehen und kurz mit der maus die ansicht zu drehen. Ist der fehler aufgetreten, bricht das mesh sofort zusammen.
Backup wieder herstellen und nochmal von vorne. Immer wieder toll.