In WED Rechtsklick auf "Textures" links im Priketbereich. Dann im Kontextmenu "Texture Manager..." wählen, mit "Add Folder" einen Ordner wählen und mit "Build WAD" speichern. Müsste so gehen. Es ist aber eigentlich nicht nötig eine WAD-Datei zu erzeugen. Die Angabe des Ordners reicht.